Metafor es una de las bibliotecas más importantes y conocidas de R para realizar meta-análisis. Por supuesto, para poder usar este programa es necesario tener instalado previamente el entorno R. Sin embargo, en esta ocasión puede ser bastante útil usar RStudio. Haciendo clic en los siguientes botones se puede repasar la forma de instalar R y RStudio respectivamente.
En esta entrada veremos cómo se instala las bibliotecas necesarias para realizar un meta-análisis básico pero completo con RStudio. En concreto hay que instalar el paquete metafor y tidyverse.
Biblioteca metafor
Con RStudio la instalación de paquetes o bibliotecas es prácticamente idéntica a instalar paquetes en el entorno (puro) de R. Básicamente, para instalar cualquier paquete en RStudio se debe poner la instrucción install.packages ("nombre del paquete"). Es importante recalcar que el nombre del paquete debe ir entre comillas. El comando se deberá poner en el editor de código, que se puede activar pulsando el icono que se muestra en la siguiente imagen:
> install.packages ("metafor")
Lo que a continuación hay que hacer es seleccionar este comando y pulsar sobre el botón RUN, ubicado en la parte de arriba de la ventana del Script. En la Consola de R (ventana inferior izquierda) veremos cómo se realiza la instalación.
La instalación se habrá realizado de manera correcta cuando la Consola de R muestre el mensaje del directorio en el que se ha guardado la biblioteca. En este caso particular fue:
The downloaded binary packages are in
/var/folders/gg/29lmc3451z13gwk420zptkykyh0000gn/T//RtmpcutBf6/downloaded_packages
Biblioteca tidyverse
Adicionalmente habrá que instalar la biblioteca tidyverse. Para ello seguiremos el mismo procedimiento anterior: (1) escribir el comando, (2) seleccionar con el cursor el comando y (3) hacer clic en RUN.
> install.packages ("tidyverse")
Lo cierto es que la instalación de este segundo paquete tarda un poco más que el primero.
Primera (y última) vez
Recordemos que estas operaciones solo se deben hacer la primera vez. Una vez que la biblioteca esté instalada en RStudio (R en realidad) deberemos abrirlas (y esto deberá de ser así cada vez que abramos una nueva sesión) con los comandos:
> library (metafor)
> library (tidyverse)
Seguir aprendiendo
En la siguiente entrada veremos cómo debemos crear la base de datos en Excel para poder importarla de manara correcta en RStudio y poder realizar, posteriormente, el meta-análisis. Haz clic en el siguiente botón para acceder a este contenido.
Jacob Sierra Díaz y Alti
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