jueves, 13 de febrero de 2025

RStudio - Metafor | Meta-análisis convencional de efectos aleatorios

Hoy vamos a realizar un meta-análisis convencional con la base de datos que hemos ido introduciendo en las entradas anteriores. Puedes hacer clic en el siguiente botón para acceder a la base de datos que se va a emplear. 

Antes de comenzar...

Para realizar este meta-análisis, se recuerda que se tienen que tener activas las bibliotecas metafor y tidyverse

> library (metafor)
> library (tidyverse)

Para realizar este meta-análisis será necesario haber calculado los tamaños del efecto y sus varianzas previamente (yi y vi, respectivamente si se tiene en cuenta el análisis efectuado en RStudio). Puedes hacer clic en el siguiente botón para recordar cómo se realiza este procedimiento. 


1.1 | Efectos aleatorios globales

Lo primero que debemos hacer es realizar el cálculo del efectos aleatorios global (overall random effects, en inglés). Para ello usaremos la función rma (tamaño del efecto, varianza del tamaño del efecto. data = nombre de la base de datos). Normalmente la columna del tamaño del efecto tiene el nombre por defecto yi y su varianza xi (tal y como se vio en la entrada anterior). Sin embargo, como este procedimiento lo vamos a invocar después, conviene asignarle un nombre (nombre = función anterior o nombre <- función anterior). En este caso, le ponderemos el nombre globalalea (puede ser otro) y la función que habrá que correr (presionando la tecla RUN cuando se seleccione) será:

> globalalea = rma (yi, vi, data = MAbasico)

Si sirve para memorizar mejor la función, rma significa Random effect Meta-Analysis. Para ver este resultado, deberemos escribir el nombre asignado (globalalea) y hacer clic en RUN. 



1.2 | Interpretación de los resultados

Cuando se ejecute el nombre de la función descrita anteriormente (globalalea en este ejemplo), en la consola de R aparecerán los resultados del meta-análisis. 

Lo primero que vemos es el título del análisis seguido del número de artículos de la base de datos (k = 27) y el estimador tau al cuadrado (REML). Lo que más nos interesa ahora es ir a la parte de Model Results y ver el estimate, que es el tamaño del efecto global de los tamaños del efecto estandarizados de cada uno de los artículos objeto de análisis (estimate = 0.6106). En términos de andar por casa, la interpretación es similar a como se interpreta la d de Cohen, siendo un valor de 0,600 un efecto moderado. A continuación vemos el error estándar (se = 0.1143), el valor z (zvalue = 5.3409) y el p-valor que nos dice si es estadísticamente significativo el tamaño del efecto global (< 0.0001). En este caso, observamos que sí que lo es. A continuación vemos el límite inferior del intervalo de confianza (ci. lb = 0.3865) y el límite superior del intervalo de confianza (ci. ub = 0.8346)



1.3 | Estudio de la heterogeneidad

Lo siguiente que hay que ver es la heterogeneidad. No es necesario calcularla a parte porque ya se calcula por defecto con el procedimiento visto en el apartado 1.1. 
  • Lo que primero se recomienda mirar es el Test for heterogeneity, que es un test q. Este estadístico nos informa de si la heterogeneidad es significativa en nuestro análisis (consultando el p-valor). En la práctica, cuando el p-valor es menor a 0,050 es conveniente complementarlo con un análisis de moderación. 
  • A continuación, se debe mirar la I^2,  que se trata de un porcentaje que nos informa de cuánta variación tiene verdaderamente la heterogeneidad. Un valor entre el 70% y 100% se considera un porcentaje considerable. Recordemos que entre 50% y 70% se considera un valor sustancial. Sin lugar a dudas, en este ejemplo, estamos ante un caso realmente elevado, que nos debe invitar a la idea de hacer un análisis de moderación.
  • Por último, se debe mirar el tau^2, que informa de la varianza estimada del verdadero efecto. Por tanto, este valor se interpreta como un tamaño del efecto como el de la diferencia de medias estandarizadas. Se trata, por tanto, de la varianza entre la heterogeneidad de los estudios objeto de estudios. 



Seguir aprendiendo

En la siguiente entrada veremos la forma de generar uno de los gráficos más famosos del meta-análisis: el forest plot. Puedes hacer clic en el siguiente botón para acceder al siguiente contenido y aprender el siguiente paso para realizar un meta-análisis:

    Jacob Sierra Díaz y Alti


    martes, 11 de febrero de 2025

    RStudio - Metafor | Cálculo de la diferencia de medias estandarizadas

    Como ya es bien conocido, un meta-análisis trabaja con el concepto de tamaños del efecto. Uno de los tamaños del efecto más comunes cuando existen datos de la media, desviación típica y tamaño muestral del grupo control y experimental es la diferencia de medias estandarizadas. (Standarized Mean Difference o SMD en inglés).

    En esta entrada vamos a partir de la base de datos de Excel que hemos introducido en entradas anteriores de este mes y que hemos cargado en RStudio. Puedes hacer clic en el siguiente botón para aprender o refrescar cómo se debe hacer la carga de los datos correctamente. 
    • Recordemos que estamos usando el archivo MA Basico, que previamente hemos importado a RStudio con un ordenador Mac. No obstante, estas operaciones son similares en un ordenador Windows. Recordemos que el nombre de la base en R es MAbasico (que podría haber sido otro nombre).


    Bibliotecas necesarias

    Recordemos que para que lo que vamos a ver hoy funcione, tenemos que tener activas las bibliotecas:

    > library (metafor)
    > library (tidyverse)

    > library (xlsx)


    Cálculo de diferencia de medias estandarizadas

    Para calcular la diferencia de medias estandarizadas (SMD; Standarized Mean Differences en inglés) debemos pedir que RStudio añada dos nuevas columnas con los tamaños del efecto y la varianza de esos tamaños del efecto.

    En primer lugar, debemos "traducir" las funciones de nuestra base de datos a las funciones de la biblioteca metafor. Para ello, vamos a solicitar que los nombres de MAbasico se transformen. Para ello, debemos usar la función escalc (que se es el acrónimo de effect size calculation) en la que también pediremos la instrucción de measure = "SMD" [diferencias de medias estandarizadas]. A continuación, se debe introducir el nombre de las variables que pone metafor seguido del nombre que habíamos puesto en nuestra base de datos. En metafor los nombres son m1i (mean group 1 intervention; media del grupo 1), sd1i (standard deviation 1 intervention; desviación típica del grupo 1), n1i (n group 1 intervention; muestra del grupo 1), m2i (mean group 2 intervention; media del grupo 2), sd2i (standard deviation 2 intervention; desviación típica del grupo 2) y n2i (n group 2 intervention; muestra del grupo 2). En este caso, grupo 1 hace referencia al grupo experimental y grupo 2 al grupo control. Entonces, después de cada uno de estos nombres tendremos que escribir la correspondencia con nuestra base de datos. En nuestro caso será m1i = med_int, sd1i = dt_int, n1i = n_int, m2i = med_cont, sd2i = dt_cont; n2i = n_cont. Por último, se debe poner la función data = nombre de la base de datos. Integrado en la siguiente función tendremos:

    > MAbasico = escalc (measure = "SMD", m1i = med_int, sd1i = dt_int, n1i = n_int, m2i = med_cont, sd2i = dt_cont, n2i = n_cont, data = MAbasico)


    Nótese que hemos usado el mismo nombre para esta función que nuestra anterior base de datos. Esto es así para que tengamos una nueva base de datos con el mismo nombre pero que incluya los cálculos del tamaño del efecto.

    Entonces, después de esta función, si invocamos el nombre MAbasico veremos que aparecerán dos nuevas columnas: yi y vi que corresponden con el tamaño del efecto (columna yi) y con la varianza del tamaño del efecto (vi).



    Seguir aprendiendo

    Ahora ya estamos listos para realizar el primer paso del meta-análisis. En la siguiente entrada veremos cómo se efectúa un meta-análisis de efectos aleatorios. Haz clic en el siguiente botón para acceder a este contenido:


    Jacob Sierra Díaz y Alti

    sábado, 8 de febrero de 2025

    RStudio - Metafor | Importación de la base de datos formato .xlsx

    En la entrada anterior vimos la forma más sencilla de generar la base de datos con Excel (o cualquier programa similar). Hoy veremos la manera de importar esa base de datos en RStudio. Puedes hacer clic en el siguiente botón para acceder a la entrada anterior y descargarte la base de datos.


    Bibliotecas necesarias

    A partir de este momento, vamos a necesitar tener activas las bibliotecas metafor y tidyverse. Por tanto, es recomendable comenzar a cargar estos paquetes con los comandos:

    > library (metafor)
    > library (tidyverse)

    Además, para poder leer correctamente la base de datos en formato .xlsx deberemos invocar la biblioteca xlsx
    • Si es la primera vez que se instala esta biblioteca para leer archivos Excel deberemos escribir la función  install.packages ("xlsx")
    • Si ya está instalado el paquete, habrá que abrirlo con la función library (xlsx)
    En RStudio se pueden poner las tres instrucciones en el editor de código (R Script), en este caso la carga de las tres bibliotecas que se necesitan, señalarlas con el cursor y hacer clic en RUN


    Importación mediante ruta

    Una vez abierta la biblioteca xlsx, la función que usamos para cargar nuestra base de datos (en este caso en formato .xlsx) es mediante el comando:
    read.xlsx ("ruta de la base de datos o archivo, incluyendo su nombre y la extensión", sheetName = "hoja en la que está la base")

    En efecto, vamos a tener que saber la ruta en la que se encuentra el archivo. Supongamos que en este caso nuestra base de datos tiene el nombre de "MA basico" y está alojada en el escritorio del ordenador. Tal y como se muestra en la siguiente imagen, independientemente del sistema operativo, haciendo clic en las propiedades del archivo ("Obtener información" en ordenadores Mac) podremos conocer exactamente la ruta en la que se encuentra.



    Llegados a este punto conviene avisar que nunca es recomendable importar directamente la base de datos. Lo que debemos hacer es asignar un nombre previamente al proceso que no tenga espacios. Esto servirá para luego poder invocar esa base de datos de una manera más cómoda. En este caso, llamaremos a la base de datos del mismo modo que el archivo (pero sin espacio). Por tanto, para este ejemplo, usando un ordenador Mac, la ruta será la siguiente:

    > MAbasico = read.xlsx ("/Users/manueljacobsierra-diaz/Desktop/MA Basico.xlsx", sheetName = "Hoja1")


    Entonces, cada vez que se quiera consultar o hacer referencia a la base de datos, podremos usar el nombre (en este caso) MAbasico. En el espacio de trabajo (ventana superior derecha) se puede observar cómo aparece un icono con la base de datos cargada. Haciendo clic en el icono azul aparecerán los nombres de las variables, tal y como se muestra en la siguiente imagen:



    Podemos verificar que los datos se han metido correctamente escribiendo el nombre que hemos creado anteriormente. En este caso llamado MAbasico. En la consola de R se verán todos los datos de la base. 


    Con esto ya estamos listo para comenzar el procedimiento del meta-análisis propiamente dicho.


    Seguir aprendiendo

    En la siguiente entrada comenzaremos a dar los primeros pasos del meta-análisis propiamente dicho. En concreto, veremos el cálculo del tamaño del efecto para este tipo de datos (diferencia de medias estandarizadas). Haz clic en el siguiente botón para acceder al siguiente aprendizaje:


    Jacob Sierra Díaz y Alti

    jueves, 6 de febrero de 2025

    RStudio - Metafor | Preparación de la base de datos en Excel

    Hoy vamos a ver la forma en la que se debe preparar la base de datos para hacer un meta-análisis básico en RStudio con el paquete metafor. Para ello, lo más recomendable, debido a su sencillez y a ser lo más intuitivo, es usar una hoja de cálculo, como Excel (Microsoft), Numbers (Apple), Hojas de cálculo (Google) o similares.

    Ya que a lo largo de este mes vamos a ir viendo una primera aproximación básica al meta-análisis, vamos a preparar un Excel con los datos más elementales. En este ejemplo se usará la versión 16.94 de Excel para Mac. No obstante, es indistinto la versión que se vaya a usar, al igual que el sistema operativo). 


    Elementos básicos

    Cada columna de Excel, empezando por la A será una variable distinta. Cada fila será un caso distinto. Para los meta-análisis, cada caso suele ser un artículo distinto. Para un meta-análisis básico necesitaremos extraer de cada estudio objeto de análisis la media artimética, la desviación típica y el tamaño muestral de los grupos experimentales y controles.

    Es recomendable llamar a estas variables de una forma que no queden espacio entre los nombres y que sean fácilmente identificables. Por ejemplo: "mediaexp" para la media del grupo experimental, "dtcont" para la desviación típica del grupo control o "nexp" para el tamaño muestral del grupo experimental. Así, podremos invocar las variables mucho más fácilmente en R. 


    Lo más fácil para trabajar es que toda la base de datos quede completada. Esto quiere decir que es recomendable que no quede ninguna casilla sin valor (celdas vacías). Al ser una introducción al meta-análisis, adoptaremos en esta serie de entradas este supuesto. En otro momento se explicará qué se debe hacer cuando hay estudios incompletos.

    Por último y, curiosamente lo primero que debe aparecer en la base de datos, sería añadir la identificación de los estudios. Normalmente se pondrá el apellido del primer autor seguido del año de publicación. Se suelen poner otras variables moderadoras tales como el tipo de estudio o el país, aunque las variables esenciales para el meta-análisis se han dicho en primer lugar.

    En definitiva, los elementos que deben aparecer y que se pondrán en la primera fila (la 1) son los respectivos nombres de:
    • Identificador
    • Otras variables descriptivas: país, tipo de publicación u otras variables categóricas
    • Media del grupo experimental
    • Desviación típica del grupo experimental
    • Tamaño muestral del grupo experimental
    • Media del grupo control
    • Desviación típica del grupo control
    • Tamaño muestral del grupo control

    Por último, cabe mencionar que la separación decimal en un Excel en castellano debe hacerse con coma y no con punto. Posteriormente veremos que al subirlo a RStudio (si tiene interfaz en inglés), lo convertirá en punto.


    Configuración del Excel

    Entonces, cada elemento descrito anteriormente será cada columna de la base de datos. En cada fila deberemos de poner los datos que se extraigan de cada estudio. Es recomendable no cortar y pegar datos en la hoja que se va a usar como base de datos en R, ya que puede que alguna columna o fila adicional se accione y de un error posterior en el meta-análisis.
    • Hay ciertas investigaciones que pueden incluir varios datos independientes que se podrían meta-analizar. Es decir, que a lo mejor haya más de un valor de las variables objeto de estudio. Esto suele ser cuando un estudio usa dos instrumentos para medir el mismo outcome. En tal caso, se deberán poner en filas distintas como si se tratasen de estudios independientes. Por supuesto, aquí habría que identificar a los autores con una letra adicional.

    En la siguiente imagen se muestra la forma de una base de datos para un meta-análisis básico en R. Nótese que los colores puestos representan estudios que cuentan con más de un valor en la variable objeto de análisis. 



    En esta serie de entradas usaremos esta base de datos ficticia para hacer el primer meta-análisis con el paquete Metafor. Puedes hacer clic en el siguiente botón para acceder y descargarte esta base de datos. La contraseña para acceder a esta base es Metalisis.




    Seguir aprendiendo

    Una vez visto cómo se genera la base de datos, es hora de importarla en RStudio. Para ello, haz clic en el siguiente botón para acceder al siguiente contenido y ver cómo importar correctamente la base de datos:



    Jacob Sierra Díaz y Alti

    martes, 4 de febrero de 2025

    RStudio - Metafor | Instalación de la biblioteca

    Metafor es una de las bibliotecas más importantes y conocidas de R para realizar meta-análisis. Por supuesto, para poder usar este programa es necesario tener instalado previamente el entorno R. Sin embargo, en esta ocasión puede ser bastante útil usar RStudio. Haciendo clic en los siguientes botones se puede repasar la forma de instalar R y RStudio respectivamente.




    En esta entrada veremos cómo se instala las bibliotecas necesarias para realizar un meta-análisis básico pero completo con RStudio. En concreto hay que instalar el paquete metafor y tidyverse.


    Biblioteca metafor

    Con RStudio la instalación de paquetes o bibliotecas es prácticamente idéntica a instalar paquetes en el entorno (puro) de R. Básicamente, para instalar cualquier paquete en RStudio se debe poner la instrucción install.packages ("nombre del paquete"). Es importante recalcar que el nombre del paquete debe ir entre comillas. El comando se deberá poner en el editor de código, que se puede activar pulsando el icono que se muestra en la siguiente imagen:


    En la primera línea del documento escribiremos el comando de instalación de metafor (por supuesto, sin el >):

    > install.packages ("metafor")

    Lo que a continuación hay que hacer es seleccionar este comando y pulsar sobre el botón RUN, ubicado en la parte de arriba de la ventana del Script. En la Consola de R (ventana inferior izquierda) veremos cómo se realiza la instalación.


    La instalación se habrá realizado de manera correcta cuando la Consola de R muestre el mensaje del directorio en el que se ha guardado la biblioteca. En este caso particular fue:

    The downloaded binary packages are in 
    /var/folders/gg/29lmc3451z13gwk420zptkykyh0000gn/T//RtmpcutBf6/downloaded_packages


    Biblioteca tidyverse

    Adicionalmente habrá que instalar la biblioteca tidyverse. Para ello seguiremos el mismo procedimiento anterior: (1) escribir el comando, (2) seleccionar con el cursor el comando y (3) hacer clic en RUN.

    > install.packages ("tidyverse")

    Lo cierto es que la instalación de este segundo paquete tarda un poco más que el primero. 


    Nuevamente, cuando aparezca el mensaje The downloaded binary packages are in [ruta o directorio] significará que se ha instalado correctamente.


    Primera (y última) vez

    Recordemos que estas operaciones solo se deben hacer la primera vez. Una vez que la biblioteca esté instalada en RStudio (R en realidad) deberemos abrirlas (y esto deberá de ser así cada vez que abramos una nueva sesión) con los comandos:

    > library (metafor)
    > library (tidyverse)


    Seguir aprendiendo

    En la siguiente entrada veremos cómo debemos crear la base de datos en Excel para poder importarla de manara correcta en RStudio y poder realizar, posteriormente, el meta-análisis. Haz clic en el siguiente botón para acceder a este contenido. 


    Jacob Sierra Díaz y Alti

    viernes, 15 de noviembre de 2024

    R - Estadística | Contraste chi-cuadrado de homogeneidad

    Cuando queremos comparar las diferencias significativas entre dos grupos con una variable categórica nominal u ordinal (que contenga frecuencias o recuentos) no podemos emplear las técnicas estadísticas vistas en los días anteriores que analiza las varianzas de dos grupos. En consecuencia, deberemos usar la prueba chi-cuadrado (X2de homogeneidad para varias muestras. En realidad, esta prueba se puede usar para dos o más poblaciones (o, de manera práctica, grupo). 



    Caso práctico

    Se quiere saber si existen o no diferencias significativas entre estudiantes universitarios fumadores y no fumadores en dos cursos del grado de Pedagogía. Por tanto, la muestra se compone de estudiantes  del primer y segundo curso que han querido participar en el estudio. Los resultados se han clasificado en fumadores y no fumadores en la siguiente especie de tabla:

    Curso                  Fumadores        No fumadores
    PRIMERO               16                        23
    SEGUNDO              19                        28


    Cuando se plantea este tipo de casos, estadísticamente hablando debemos preguntarnos: ¿se puede considerar homogéneo las dos poblaciones respecto al hábito fumador? Específicamente observamos que la variable categórica (hábito fumador) se compone de dos clases (fumador y no fumador), que a su vez está clasificada en una variable independiente (curso) de dos grupos (primero y segundo). Esta información se puede resumir en una tabla de frecuencias donde tenemos desglosada las frecuencias observadas (16, 23, 19 y 28 en este ejemplo) y se pueden calcular el sumatorio o total de la muestra. En efecto, lo que debemos hacer para responder a la pregunta del caso práctico será un test chi-cuadrado (X2) de homogeneidad. En concreto, se deberá realizar el estadístico de Pearson (la suma de las frecuencias observadas menos las esperadas) para contrastar la hipótesis nula (Ho) de que los grupos son homogéneos.

    Para este ejemplo, se empleará directamente el entorno R (versión 4.4.2) en un ordenador Lenovo YB1-X91F (con sistema operativo Windows 10). Este mismo proceso se puede hacer en un ordenador Mac. Por supuesto, este mismo proceso se puede ejecutar en RStudio. Los datos se introducirán directamente en la consola de R, tal y como se mostrará a continuación.


    Procedimiento

    En primer lugar, debemos introducir los valores en forma de tabla de frecuencias, tal y como aparece en el caso práctico. Para ello, deberemos recurrir a la función matrix (c(...)). Como esta matriz va a tener dos columnas, que son las categorías "Fumadores" y "No fumadores" deberemos especificarlo en la instrucción ncol =. El orden para introducir los datos será por columnas o vertical (metemos ordenadamente los datos de la primera columna y pasamos a meter los datos ordenados de la segunda). A esta matriz, la vamos a llamar Habito.

    > Habito = matrix (c(16, 19, 23, 28), ncol=2)


    Para que la matriz se parezca a una tabla de frecuencias, podremos los nombres de cada fila y columna con los comandos colnames (nombre matriz) = c ("nombre de la columna 1", "nombre de la columna 2") y rownames (nombre matriz) = c ("nombre de la fila 1", "nombre de la fila 2"). Entonces, para este ejemplo:

    > colnames (Habito) = c("Fumadores", "No fumadores")
    > rownames (Habito) = c("Primero", "Segundo")

     
    Podemos invocar el nombre de la matriz para visualizar si hemos metido bien la información.

    A continuación, es hora de solicitar el test chi-cuadrado de homogeneidad. Esto se hace sencillamente con la función chisq.test (nombre de la matriz). Entonces en este caso, será

    > chisq.test (Habito)


    Adicionalmente podemos solicitar la tabla de frecuencias esperadas añadiendo a la función anterior. $ expected. Es decir:

    > chisq.test (Habito) $ expected


    Resultados e interpretación

    Lo que se debe observar en este test es el p-valor. Si este es menor de 0,050 (suele ser lo deseable) se puede rechazar la hipótesis nula (Ho) de homogeneidad y concluir que existen diferencias significativas en ambos grupos. Tal y como se muestra en la siguiente ilustración, también es recomendable comparar los datos con las frecuencias esperadas y darse cuenta si esas diferencias son significativas. Los resultados de este test también dan el estadístico de Pearson (x-squared) con los grados de libertad (df).


    • El p-valor dela prueba de homogeneidad chi-cuadrado es 1, lo que puede confirmar la hipótesis de que los dos grupos (el curso) son homogéneos respecto a los hábitos fumadores. En otras palabras, no hay diferencias significativas entre los estudiantes de primero y de segundo relativas a fumar o no fumar.


    Seguir aprendiendo

    Hasta aquí la serie de pruebas de contraste de hipótesis para únicamente dos grupos. En las siguientes entradas, veremos las familia de pruebas para más de dos grupos. Puedes hacer clic en el siguiente botón para acceder al procedimiento de Análisis de Varianza:




    Jacob Sierra Díaz y Alti

    miércoles, 13 de noviembre de 2024

    R - Estadística | Diferencia significativa de un grupo sobre otro

    En los últimos días hemos visto la forma de realizar pruebas estadísticas para demostrar diferencias significativas (o no) entre dos grupos teniendo en cuenta una variable dependiente. Puedes hacer clic en los siguientes botones para acceder a las entradas para recordar estas pruebas. 






    En esencia con estas pruebas estadísticas contrastamos dos hipótesis.

    En el caso de las pruebas paramétricas:

    • Ho | Las medias de los dos grupos (a y b) son iguales | Xa = Xb
    • H1 | Las medias de los dos grupos (a y b) no son iguales | Xa ≠ Xb


    En el caso de las pruebas no paramétricas:
    • Ho | Las medianas de los dos grupos (a y b) son iguales | Ma = Mb
    • H1 | Las medianas de los dos grupos (a y b) no son iguales | Ma ≠ Mb


    Contraste de un grupo distinto a otro (Ya > Yb)

    En las cuatro entradas anteriores hemos aprendido que si hacemos estos test por defecto en el entorno de R, verificaremos si hay que aceptar la hipótesis nula (Ho) o aceptar la hipótesis alternativa (H1). Pero este test solo nos da información sobre igualdad o desigualdad significativa (entre los dos grupos).

    Para saber qué grupo es superior (o inferior) podemos extraer las medias y las cuasidesviaciones típicas de ambos grupos en el entorno R. Sin embargo, también se puede añadir una instrucción dentro de las funciones del test seleccionado. Entonces, cuando queramos verificar que la media (o la mediana) del grupo A es superior a la media (o mediana) del grupo B [Grupo A > Grupo B], esta la colocaremos como hipótesis alternativa (H1) ya que es lo deseable. Por tanto, debemos convertir el contraste de hipótesis que acabamos de ver a:
    • Ho | La medida (media o mediana) del grupo a es inferior a la del grupo b | Ya ≤ Yb
    • H1 | La medida del grupo a es inferior a la del grupo b | Ya > Yb

    En este caso la instrucción que se debe integrar dentro de la función de los test ya aprendidos es alternative = "greater"Vamos a recuperar un ejemplo de los vistos anteriormente para ver cómo se puede efectuar este contraste.


    Caso práctico

    Una residencia universitaria ha analizado la velocidad en la que sus residentes comen (medido en minutos). En concreto, quieren saber si hay diferencias significativas entre la velocidad en la que comen los chicos y la velocidad en la que lo hacen las chicas. A los alumnos se les pidió permiso para analizar las cámaras de seguridad del comedor y medir el tiempo en el que cogen la bandeja, comen y la vuelven a dejar para evitar la medida in situ no sesgue los resultados. Los resultados de velocidad son los siguientes:
        - Chicos: 5,3; 6,3; 7,8; 8,6; 8,9; 10,3; 11,5; 12,1; 13,3; 17,6; 14,3
        - Chicas: 11,5; 12,1; 16,3; 17,8; 24; 28,9; 40,6; 34,3; 33

    Ya vimos este ejemplo en la entrada correspondiente al test de Welch. Puedes hacer clic en el botón verde correspondiente indicado anteriormente para acceder al procedimiento completo. Se recuerda que para este tipo de prueba tenemos que verificar el supuesto de normalidad; cuestión que aquí no se mostrará.

    Para este ejemplo, se empleará directamente el entorno R (versión 4.3.1) en un ordenador MacBook Pro (con sistema operativo MacOS Ventura). Este mismo proceso se puede hacer en un ordenador con sistema operativo Windows. Por supuesto, este mismo proceso se puede ejecutar en RStudio. Los datos se introducirán directamente en la consola de R mediante dos variables vectoriales con los nombres del sexo de los residentes.


    Procedimiento

    En primer lugar, se introducirán los datos en modo de variable vectorial. En concreto, se crearán dos variables poniendo los datos separados por comas. En este caso, el orden de los datos no importan.

    > Chicos = c(5.3, 6.3, 7.8, 8.6, 8.9, 10.3, 11.5, 12.1, 13.3, 17.6, 14.3)

    > Chicas = c(11.5, 12.1, 16.3, 17.8, 24, 28.9, 40.6, 34.3, 33)

    Recordemos que nuestro contraste de hipótesis establece que:
    •  Ho: Chicos ≤ Chicas | p-valor > 0,050
    •  H1: Chicos > Chicas | p-valor < 0,050

    La función del test de Welch para este contraste de hipótesis quedará, por tanto de esta forma:

    t.test (Chicos, Chicas, var.equal = F, alternative = "greater")


    Resultados e interpretación

    El resultado que deberemos mirar es el p-valor de esta prueba. Nos tenemos que dar cuenta si es mayor a 0,050 (en tal caso las chicas tienen una media significativamente mayor) o si es menor a 0,050 (en tal caso, los chicos tienen una media significativamente mayor). Esto mismo se puede verificar solicitando las medias de ambos grupos, mediante mean (Nombre de la variable vectorial del grupo) tal y como se muestra en la siguiente imagen: 


    • Se tienen suficientes evidencias como para mantener la hipótesis alternativa (Ho) de que el grupo de chicas tiene una media significativamente mayor de la velocidad de comida que los chicos.


    Seguir aprendiendo

    A continuación,




    Jacob Sierra Díaz y Alti